在農學研究方面,農學部的農業會計研究設施在農業會計學和農家經濟分析學方面為日本唯一的研究與教育普及部門;植物生殖設施在植物的起源、分化、傳播、遠緣雜交、遺傳資源的收集保存等方面顯示出該資源的優勢,被國際遺傳資源理事會認定為“基本銀行”而成了國際活動中心。
從日本最高學術獎學士院獎的獲獎情況更可直接看出京都大學的實力和地位。1911-1990年的80年間,京都大學出身的人共有71人獲獎,占全日本獲獎人數的12.4%。從學科上分析,經濟學與東京大學不相上下,并列第一;12個學科中有7個處于全國大學中的第2位,3個學科第3位,只有法學、政治學未能進入前3名。再從現今在京大工作的獲獎者情況比較,結果與上面差不多,除了法學、政治學外,其余11個學科均進入前3名,其中數學為第1位,7個學科第2位,3個學科第3位,綜合以上兩方面的分析,可明顯看出京大在全國大學中均已穩坐第二的交椅。